Le BSE est fortement conseillé pour les éleveurs qui, en tant que professionnels, savent reconnaître certaines maladies de leurs animaux et utilisent fréquemment certains produits pharmaceutiques. A contrario, pour l'éleveur qui utilise très peu de produits pharmaceutiques ou qui ne gère que quelques animaux, le BSE n'est pas nécessaire.
D'un point de vue réglementaire, le choix de ne pas réaliser un BSE implique pour le vétérinaire, l'impossibilité de prescrire un médicament sans consultation du ou des animaux concernés.
La tarification forfaitaire du BSE doit être comprise comme la prise en charge d'un suivi global sur l'année des aspects sanitaires de votre élevage. Les conversations téléphoniques au cours de l'année ainsi que les visites évitées dans votre élevage, compensent largement l'investissement du BSE.